長期以來，有害生物與生物恐怖密切相關，歷史上曾經發生的多次生物恐怖攻擊，絕大多數都與有害生物有關。目前已知或公布過的28種病原微生物可作為生物戰劑，其中有十多種在施放方式、傳播途徑上與有害生物相關聯。

使用生物致病因子作為攻擊武器稱為生物恐怖。通過多種途徑散布致病性細菌、病毒等，造成烈性傳染病的暴發流行，致使人群傷亡，并引起公眾恐慌和社會動蕩。恐怖方式包括施放細菌氣溶膠，拋撒細菌或病毒污染水源和食品，置放細菌或病毒于物品、信件中夾帶或傳遞，投放帶菌帶病毒昆蟲和動物等。雖然生物恐怖早已受到公開的譴責，而且世界上許多國家在《禁止生物武器公約》上簽字，但是由于將生物因子用于戰爭或攻擊，可能取得極大的效果，并且由于生物戰劑造價低廉，技術難度不大，研制時容易隱蔽，幾乎可以在任何地方研制和生產，不少國家和組織出自不同的目的，仍然沒有停止研制。尤其是一些別有用心的個人、組織則對此越來越關注。目前地球上有許多種病毒、細菌可以被恐怖分子用于罪惡的目的，給國際和地區局勢帶來諸多不穩定因素，對人類自身生存和發展提出了嚴重的挑戰。隨著微生物學和科學技術進步，反生物恐怖的難度更大。全世界都開始關注生物恐怖的嚴重性和恐怖性。防止生物恐怖，是世界上許多國家正面臨的重大難題，中國亦不例外。可以預見，在今后的時間里，世界反恐形勢會變得更加復雜、嚴峻，恐怖襲擊的手段更加靈活，同時生物武器可能會成為恐怖分子的首選。